La Chiesa di San Carlo Borromeo, cuore pulsante della comunità di Poggiodomo, fu costruita nel 1635 in sostituzione della Chiesa di S. Antonio da Padova, attualmente scomparsa. Sull'ampia facciata si apre un portale di stile rinascimentale.

Al suo interno, la semplice navata unica custodisce pregevoli altari lignei barocchi, commissionati dalle famiglie più agiate  e nobili del luogo e impreziositi da dipinti dell'epoca che ritraggono, tra gli altri, la Natività e la Visitazione. Ci sono nove altari lignei del XVII e XVIII secolo, otto sono ai lati della navata .

Spicca nell'abside una tela di grande valore raffigurante la Deposizione, proveniente dalla chiesa rupestre di Santa Filomena, i cui ruderi sono ancora visibili poco fuori dal centro storico.