Im Inneren befindet sich die Nonnenkapelle, so genannt, weil sie an das Klarissenkloster zu Ehren der Heiligen Agnes angrenzt. Diese Schwestern sind die gewissenhaften Hüterinnen der Reliquie der Heiligen Dornenkrone, die Carlo, Sohn von Braccio Fortebracci, der Bevölkerung von Montone schenkte und die jedes Jahr am Ostermontag sowie am vorletzten Sonntag im August öffentlich gezeigt wird.

 Die Kirche ist reich an Fresken und Gemälden, wie dem schönen Abendmahl, das über der Tür zur Sakristei hängt, ein Werk des flämischen Malers Denijs Calvaert, das aus der Kirche Santa Croce stammt und wahrscheinlich von der Familie Vitelli in Auftrag gegeben wurde.

Das Fresko an der Decke wurde hingegen von Giovanni Parenti, dem Leiter der Florentiner Akademie, geschaffen. Es stammt aus der ersten Hälfte des 18. Jahrhunderts und zeigt die Apostel, die auf das Herabkommen des Heiligen Geistes warten. Derselbe Maler fertigte auch das Gemälde mit den Seelen im Fegefeuer, die durch die Fürsprache der Heiligen vor der Dreifaltigkeit gerettet werden, sowie das interessante Altarbild mit der Madonna zwischen den Heiligen Johannes dem Täufer und Gregor dem Großen.